Borneo meningkatkan intensitas serangannya di babak kedua. Tuan rumah mendapat dua peluang melalui Terens Puhiri dan Stefano Lilipaly. Andhika kembali menjadi mimpi buruk Borneo FC karena mampu menggagalkan dua peluang tersebut.
Secara mengejutkan, Persebaya mampu unggul terlebih dahulu pada menit ke-85. Pemain pengganti Toni Firmansyah mencetak gol usai menyambar bola liar melalui tendangan voli ke sudut gawang Borneo FC.
Borneo terus menyerang hingga sisa pertandingan. Alhasil, mereka mampu menyamakan skor pada menit ke-90+2 lewat gol bunuh diri Kasim Botan yang salah memblok umpan silang pemain Borneo FC.
Gol balasan ini menimbulkan keributan di lapangan. Persebaya harus tertinggal dari Paulo Henrique yang diberi kartu merah oleh wasit.
Borneo FC semakin percaya diri. Mereka mampu membalikkan kedudukan di menit kedelapan masa tambahan waktu. Iksan Zikrak menjadi pahlawan setelah menyelesaikan umpan Silverio Silva. Pertandingan berakhir 2-1 untuk Borneo FC.